Генетические манипуляции или как имитировать ДНК клетки-хозяина


ЗАКАЗАТЬ ТЕСТОВЫЙ ПОИСК
Характеристики
Категория:
Биотехнологии
Описание проекта

Трудности, связанные с генетической инженерией многих бактерий, препятствуют биотехнологическому и коммерческому развитию пробиотических бактериальных видов и использованию бактерий в промышленном производстве биотоплива. Более того, генетическая неподатливость затрудняет изучение многих болезнетворных бактерий.

Известные методы создания организма, доступного для генетической манипуляции, являются дорогостоящими, трудоемкими, технически сложными и не могут применяться для всех видов бактерий. Таким образом, существует необходимость в усовершенствованных способах генетического манипулирования неподатливыми организмами.

Forsyth.jpg

Одно из возможных решений предложено институтом The Forsyth Institute (US) в патенте WO2018071841, в котором раскрываются модифицированные полинуклеотидные последовательности, имитирующие ДНК клетки-хозяина, а также способы использования таких последовательностей для генной инженерии бактерий.

Суть изобретения
Способ получения «ДНК, имитирующей хозяина» или «сингенной ДНК» включают такие стадии, как идентификация, сборка, адаптация и синтез. После расшифровки генетической последовательности генома и эпигемона на первой стадии, оставшиеся стадии выполняются с использованием компьютерного моделирования. 

Способ получения сингенного полинуклеотида включает в себя: 

(а) идентификацию сайтов рестрикции системы рестрикции-модификации ДНК и семейства последовательностей ДНК антивирусного защитного механизма бактерий и архей в полинуклеотидной последовательности, полученной из интересующих бактерий; 

(b) обнаружение сайтов рестрикции, указанных в пункте (а) в гетерологичном полинуклеотиде, а также 

(c) модификацию полинуклеотидной последовательности гетерологичного полинуклеотида для изменения одного или нескольких указанных сайтов рестрикции, тем самым получая сингенный полинуклеотид, который противостоит деградации при получении представляющих интерес бактерий.

Получаемый результат

Одной из особенностей настоящего изобретения является применение метода SyngenicDNA для преодоления барьера трансформации в двух разных штаммах T. denticola: ATCC 35405 и ATCC 33520. Метод SyngenicDNA успешно использовался для преодоления барьера трансформации в Staphylococcus aureus JE2 USA300. Клетки Staphylococcus aureus JE2 USA300 трансформировали электропорацией и эффективность трансформации каждой плазмиды сравнивали с 1-микрограммой ДНК на реакцию, в результате чего было выявлено 494-кратное увеличение эффективности трансформации, когда метод сингенной ДНК применялся к плазмиде pEPSA5.  Для наглядного представления об эффективности метода SyngenicDNA, авторы изобретения использовали четыре различные плазмиды, ознакомиться подробнее с ними можно в патенте по ссылке ниже.


pdf.png Полный текст патента можно скачать здесь

Хотите знать больше? Закажите бесплатный тестовый патентный поиск по интересующей вас теме.

В ответ на запрос вы получите:
  • Количество патентов в мире за 10 лет
  • Динамика патентования по годам и странам
  • Перечень технических задач, решаемых в патентах
  • Примеры компании и их новейших разработок
Скачать пример отчета вы можете здесь 
Заказать патентные исследования можно здесь
Получить патент на свое изобретение здесь